Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Syf2Q9D198 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Syf2Q9D198 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms