Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Susd3Q9D176 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Susd3Q9D176 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Susd3Q9D176 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Susd3Q9D176 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Susd3Q9D176 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Susd3Q9D176 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Susd3Q9D176 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Susd3Q9D176 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Susd3Q9D176 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Susd3Q9D176 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms