Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms