Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Exo5Q9CXP9 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Exo5Q9CXP9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Exo5Q9CXP9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Exo5Q9CXP9 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Exo5Q9CXP9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Exo5Q9CXP9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Exo5Q9CXP9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms