Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
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Rpusd4Q9CWX4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Rpusd4Q9CWX4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Rpusd4Q9CWX4 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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