Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NubplQ9CWD8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms