Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smurf1Q9CUN6 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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