Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms