Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
Higd2aQ9CQJ1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 455.3 ms