Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nudt21Q9CQF3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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