Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ncbp2Q9CQ49 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ncbp2Q9CQ49 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms