Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atg3Q9CPX6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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