Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup155Q99P88 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nup155Q99P88 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nup155Q99P88 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms