Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrrtQ99MR6 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms