Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gins4Q99LZ3 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gins4Q99LZ3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gins4Q99LZ3 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gins4Q99LZ3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gins4Q99LZ3 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gins4Q99LZ3 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gins4Q99LZ3 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gins4Q99LZ3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gins4Q99LZ3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gins4Q99LZ3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gins4Q99LZ3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gins4Q99LZ3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gins4Q99LZ3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gins4Q99LZ3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gins4Q99LZ3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gins4Q99LZ3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gins4Q99LZ3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms