Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Nus1Q99LJ8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Nus1Q99LJ8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Nus1Q99LJ8 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Nus1Q99LJ8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Nus1Q99LJ8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Nus1Q99LJ8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Nus1Q99LJ8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Nus1Q99LJ8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Nus1Q99LJ8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Nus1Q99LJ8 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Nus1Q99LJ8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Nus1Q99LJ8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Nus1Q99LJ8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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