Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pacsin3Q99JB8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms