Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Rnf144aQ925F3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rnf144aQ925F3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Rnf144aQ925F3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf144aQ925F3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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