Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccdc115Q8VE99 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccdc115Q8VE99 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccdc115Q8VE99 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccdc115Q8VE99 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ccdc115Q8VE99 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ccdc115Q8VE99 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ccdc115Q8VE99 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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