Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc8Q8VD72 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms