Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Dnajc28Q8VCE1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Dnajc28Q8VCE1 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Dnajc28Q8VCE1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Dnajc28Q8VCE1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Dnajc28Q8VCE1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Dnajc28Q8VCE1 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Dnajc28Q8VCE1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Dnajc28Q8VCE1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Dnajc28Q8VCE1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Dnajc28Q8VCE1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dnajc28Q8VCE1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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