Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hecw1Q8K4P8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hecw1Q8K4P8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms