Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Depp1Q8K2F3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms