Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Ercc8Q8CFD5 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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