Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Snx8Q8CFD4 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms