Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh13Q8CEE7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh13Q8CEE7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh13Q8CEE7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh13Q8CEE7 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh13Q8CEE7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh13Q8CEE7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh13Q8CEE7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh13Q8CEE7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh13Q8CEE7 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rdh13Q8CEE7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rdh13Q8CEE7 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms