Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RybpQ8CCI5 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 274.1 ms