Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Atg16l1Q8C0J2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atg16l1Q8C0J2 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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