Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
FarsaQ8C0C7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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FarsaQ8C0C7 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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FarsaQ8C0C7 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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FarsaQ8C0C7 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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FarsaQ8C0C7 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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