Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usp38Q8BW70 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp38Q8BW70 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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