Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubash3bQ8BGG7 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms