Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H2-M10.5Q85ZW7 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms