Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrfn4Q80XU8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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