Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dsg1cQ7TSF0 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms