Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Actn1Q7TPR4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms