Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.9 ms