Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Trappc6aQ78XR0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Trappc6aQ78XR0 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms