Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim12Q78RX3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms