Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ssxb3Q6XAS4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ssxb3Q6XAS4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms