Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nup98Q6PFD9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup98Q6PFD9 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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