Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms