Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ecm29Q6PDI5 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ecm29Q6PDI5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ecm29Q6PDI5 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ecm29Q6PDI5 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ecm29Q6PDI5 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ecm29Q6PDI5 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ecm29Q6PDI5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ecm29Q6PDI5 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ecm29Q6PDI5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ecm29Q6PDI5 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ecm29Q6PDI5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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