Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp49Q6P9L4 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms