Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smchd1Q6P5D8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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