Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg16l2Q6KAU8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms