Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms