Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Tpm4Q6IRU2 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tpm4Q6IRU2 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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