Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprjQ64455 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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PtprjQ64455 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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PtprjQ64455 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprjQ64455 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms