Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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