Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ifi47Q61635 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms